Leistungsverzeichnis

panel : ID094.01
Fettstoffwechselstörung durch LDL-Mangel : 10 Gene (29,571 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ANGPTL3 605019 AR Hypobetalipoproteinämie (FHBL2) SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPTL4 615881 AD Erniedrigung des LDL-Cholesterinspiegels SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPTL8 616223 AD Erniedrigung des LDL-Cholesterinspiegels SNV und CNV: Short Read NGS
APOB 615558 AR Hypobetalipoproteinämie (FHBL1) SNV und CNV: Short Read NGS
APOE 617347 AR, AD Erniedrigung des LDL-Cholesterinspiegels (LDLCQ5) SNV und CNV: Short Read NGS
LIMA1 618079 AD Erniedrigung des LDL-Cholesterinspiegels (LDLCQ8) SNV und CNV: Short Read NGS
MTTP 200100 AR Abetalipoproteinämie (ABL) SNV und CNV: Short Read NGS
NPC1L1 617966 AD Erniedrigung des LDL-Cholesterinspiegels (LDLCQ7) SNV und CNV: Short Read NGS
PCSK9 603776 AD Erniedrigung des LDL-Cholesterinspiegels (LDLCQ1) SNV und CNV: Short Read NGS
SAR1B 246700 AR Hypobetalipoproteinämie (CMRD) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Fettstoffwechselstörung durch LDL-Mangel
ANGPTL3, ANGPTL4, ANGPTL8, APOB, APOE, LIMA1, MTTP, NPC1L1, PCSK9, SAR1B
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ANGPTL3, ANGPTL4, ANGPTL8, APOB, APOE, LIMA1, MTTP, NPC1L1, PCSK9, SAR1B
HPO Terms
Decreased LDL cholesterol concentration, Hypocholesterolemia, Reduced circulating vitamin E concentration, Steatorrhea, Fat malabsorption, Abetalipoproteinemia, Nyctalopia, Progressive visual loss, Optic neuropathy, Ataxia, Gait ataxia, Dysarthria, Seizure, Intellectual disability, Growth delay, Failure to thrive, Malnutrition, Myopathy, Dysphagia, Peripheral demyelination
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