Leistungsverzeichnis

panel : ID096.01
HDL-assoziierte Fettstoffwechselstörung : 15 Gene (25,515 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ABCA1 604091 AD Primäre Hypoalphalipoproteinämie 1 SNV und CNV: Short Read NGS
ABCA1 205400 AR Tangier-Krankheit (TGD) SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPTL3 605019 AR Störung des HDL-Cholesterinspiegels SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPTL4 615881 AD Störung des HDL-Cholesterinspiegels SNV und CNV: Short Read NGS
APOA1 618463 AR Primäre Hypoalphalipoproteinämie 2 SNV und CNV: Short Read NGS
APOA1 619836 AD Intermediäre primäre Hypoalphalipoproteinämie 2 SNV und CNV: Short Read NGS
APOA2 107670 AR Apolipoprotein-A-II-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
APOA4 107690 AR Apolipoprotein-A-IV-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
APOC3 614028 AD Hyperalphalipoproteinämie (HALP2) SNV und CNV: Short Read NGS
CETP 143470 AD Hyperalphalipoproteinämie (HALP1) SNV und CNV: Short Read NGS
LCAT 136100 AR Fischaugenkrankheit (FED) SNV und CNV: Short Read NGS
LCAT 245900 AR Lecithin-Cholesterin-Acyltransferase-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
LIPC 612797 AD Störung des HDL-Cholesterinspiegels (HDLCQ12) SNV und CNV: Short Read NGS
LIPG 603684 AD Störung des HDL-Cholesterinspiegels SNV und CNV: Short Read NGS
NPC1 257220 AR Niemann-Pick-Krankheit (Typ C1, Typ D) SNV und CNV: Short Read NGS
NPC2 607625 AR Niemann-Pick-Krankheit (Typ C2) SNV und CNV: Short Read NGS
SCARB1 610762 AD Störung des HDL-Cholesterinspiegels (HDLCQ6) SNV und CNV: Short Read NGS
SMPD1 607616 AR Niemann-Pick-Krankheit (Typ A, Typ B) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
HDL-assoziierte Fettstoffwechselstörung
ABCA1, ABCA1, ANGPTL3, ANGPTL4, APOA1, APOA1, APOA2, APOA4, APOC3, CETP, LCAT, LCAT, LIPC, LIPG, NPC1, NPC2, SCARB1, SMPD1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCA1, ANGPTL3, ANGPTL4, APOA1, APOA2, APOA4, APOC3, CETP, LCAT, LIPC, LIPG, NPC1, NPC2, SCARB1, SMPD1
HPO Terms
Decreased HDL cholesterol concentration, Hypertriglyceridemia, Elevated circulating apolipoprotein A-II concentration, Decreased circulating apolipoprotein A-I concentration, Xanthomatosis, Tendon xanthomatosis, Corneal arcus, Accelerated atherosclerosis, Atherosclerosis, Coronary artery atherosclerosis, Coronary artery stenosis, Premature coronary artery atherosclerosis, Angina pectoris, Myocardial infarction, Left ventricular hypertrophy, Congestive heart failure, Cardiomyopathy, Hyperlipidemia, Hypercholesterolemia, Hypertension
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