Leistungsverzeichnis

panel : ID138.02
Erythrozytose (ECYT) : 11 Gene (13,854 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
BPGM 222800 AR ECYT8 SNV und CNV: Short Read NGS
EGLN1 609820 AD ECYT3 SNV und CNV: Short Read NGS
EPAS1 611783 AD ECYT4 SNV und CNV: Short Read NGS
EPO 617907 AD ECYT5 SNV und CNV: Short Read NGS
EPOR 133100 AD ECYT1 SNV und CNV: Short Read NGS
HBA1 617981 AD ECYT7 SNV und CNV: Short Read NGS
HBA2 617907 AD ECYT7 SNV und CNV: Short Read NGS
HBB 617981 AD ECYT6 SNV und CNV: Short Read NGS
JAK2 133100 AD ECYT SNV und CNV: Short Read NGS
SH2B3 133100 AD ECYT SNV und CNV: Short Read NGS
VHL 263400 AR ECYT2 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Erythrozytose (ECYT)
BPGM, EGLN1, EPAS1, EPO, EPOR, HBA1, HBA2, HBB, JAK2, SH2B3, VHL
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
BPGM, EGLN1, EPAS1, EPO, EPOR, HBA1, HBA2, HBB, JAK2, SH2B3, VHL
HPO Terms
Increased red blood cell count, Polycythemia, Increased hematocrit, Increased circulating hemoglobin concentration, Splenomegaly, Increased red blood cell mass, Increased circulating erythropoietin concentration, Hypertension, Headache, Syncope, Pallor, Plethora, Pulsatile tinnitus, Fatigue, Dyspnea, Vertigo, High-output congestive heart failure, Venous thrombosis, Target cells, Thrombosis
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