Leistungsverzeichnis

panel : ID203.01
Sphärozytose (SPH) und Elliptozytose (EL) : 6 Gene (26,559 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ANK1 182900 AD Sphärozytose (SPH1) SNV und CNV: Short Read NGS
EPB41 611804 AR, AD Elliptozytose (EL1) SNV und CNV: Short Read NGS
EPB42 612690 AR Sphärozytose (SPH5) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC4A1 612653 AD Sphärozytose (SPH4) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC4A1 166900 AD Elliptozytose (EL4) SNV und CNV: Short Read NGS
SPTA1 270970 AR Sphärozytose (SPH3) SNV und CNV: Short Read NGS
SPTA1 130600 AD Elliptozytose (EL2) SNV und CNV: Short Read NGS
SPTB 616649 AD Sphärozytose (SPH2) SNV und CNV: Short Read NGS
SPTB 617948 AR, AD Elliptozytose (EL3) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Sphärozytose (SPH)
ANK1, EPB42, SLC4A1, SPTA1, SPTB
Elliptozytose (EL)
EPB41, SLC4A1, SPTA1, SPTB
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ANK1, EPB41, EPB42, SLC4A1, SPTA1, SPTB
HPO Terms
Spherocytosis, Elliptocytosis, Congenital hemolytic anemia, Hemolytic anemia, Anemia, Reticulocytosis, Splenomegaly, Hyperbilirubinemia, Neonatal hyperbilirubinemia, Abnormal erythrocyte morphology, Spontaneous hemolytic crises, Increased circulating lactate dehydrogenase concentration, Fatigue, Pyropoikilocytosis, Stomatocytosis, Poikilocytosis, Acanthocytosis, Schistocytosis, Chronic hemolytic anemia
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