Leistungsverzeichnis

panel : ID347.01
Dyskeratosis congenita (DKC) : 15 Gene (24,060 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ACD 616553 AD Dyskeratosis congenita (DKCA6) SNV und CNV: Short Read NGS
ACD 616553 AR Dyskeratosis congenita (DKCB7) SNV und CNV: Short Read NGS
CTC1 612199 AR Dyskeratosis congenita (DKCB) SNV und CNV: Short Read NGS
DCLRE1B 620133 AR Dyskeratosis congenita (DKCB8) SNV und CNV: Short Read NGS
DKC1 305000 XLR Dyskeratosis congenita (DKCX) SNV und CNV: Short Read NGS
ENOSF1 620040 DD Dyskeratosis congenita (DKCD) SNV und CNV: Short Read NGS
NHP2 613987 AR Dyskeratosis congenita (DKCB2) SNV und CNV: Short Read NGS
NOP10 224230 AR Dyskeratosis congenita (DKCB1) SNV und CNV: Short Read NGS
PARN 616353 AR Dyskeratosis congenita (DKCB6) SNV und CNV: Short Read NGS
RTEL1 615190 AD Dyskeratosis congenita (DKCA4) SNV und CNV: Short Read NGS
RTEL1 615190 AR Dyskeratosis congenita (DKCB5) SNV und CNV: Short Read NGS
TERC 127550 AD Dyskeratosis congenita (DKCA1) SNV und CNV: Short Read NGS
TERT 613989 AD Dyskeratosis congenita (DKCA2) SNV und CNV: Short Read NGS
TERT 613989 AR Dyskeratosis congenita (DKCB4) SNV und CNV: Short Read NGS
TINF2 613990 AD Dyskeratosis congenita (DKCA3) SNV und CNV: Short Read NGS
TINF2 268130 AD Dyskeratosis congenita (DKCA5) SNV und CNV: Short Read NGS
TYMS 620040 DD Dyskeratosis congenita (DKCD) SNV und CNV: Short Read NGS
USB1 604173 AR Dyskeratosis congenita (DKCB) SNV und CNV: Short Read NGS
WRAP53 613988 AR Dyskeratosis congenita (DKCB3) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Dyskeratosis congenita (DKC)
ACD, ACD, CTC1, DCLRE1B, DKC1, ENOSF1, NHP2, NOP10, PARN, RTEL1, RTEL1, TERC, TERT, TERT, TINF2, TINF2, TYMS, USB1, WRAP53
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACD, CTC1, DCLRE1B, DKC1, ENOSF1, NHP2, NOP10, PARN, RTEL1, TERC, TERT, TINF2, TYMS, USB1, WRAP53
HPO Terms
Reticulate skin pigmentation, Nail dystrophy, Oral leukoplakia, Pancytopenia, Anemia, Thrombocytopenia, Neutropenia, Short telomere length, Pulmonary fibrosis, Alopecia, Growth failure, Immunodeficiency, Bone marrow hypocellularity, Bronchiectasis, Hepatic fibrosis, Leukemia, Hypopigmentation of hair, Skin atrophy, Mucocutaneous abnormality, Developmental delay
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