Leistungsverzeichnis

panel : ID174.02
Gorlin-Syndrom (BCNS) und ähnliche Krankheitsbilder : 8 Gene (25,812 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
BAP1 614327 AD Tumor-Prädispositionssyndrom (TPDS1) SNV und CNV: Short Read NGS
CYLD 605041 AD Brooke-Spiegler-Syndrom (BRSS) SNV und CNV: Short Read NGS
ELP1 155255 AD Medulloblastom-Prädispositionssyndrom SNV und CNV: Short Read NGS
GPR161 155255 AD Medulloblastom-Prädispositionssyndrom SNV und CNV: Short Read NGS
NSD1 117550 AD Sotos-Syndrom (SOTOS) SNV und CNV: Short Read NGS
PTCH1 109400 AD Basalzellnävus-Syndrom (BCNS1) SNV und CNV: Short Read NGS
PTEN 158350 AD Cowden-Syndrom (CWS1) SNV und CNV: Short Read NGS
SUFU 620343 AD Basalzellnävus-Syndrom (BCNS2) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Gorlin-Syndrom (BCNS) und ähnliche Krankheitsbilder
BAP1, CYLD, ELP1, GPR161, NSD1, PTCH1, PTEN, SUFU
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
BAP1, CYLD, ELP1, GPR161, NSD1, PTCH1, PTEN, SUFU
HPO Terms
Basal cell carcinoma, Odontogenic keratocysts of the jaw, Palmar pits, Plantar pits, Bifid ribs, Macrocephaly, Ectopic posterior pituitary, Calcification of falx cerebri, Cleft lip, Cleft palate, Palmar pits, Plantar pits, Bifid ribs, Macrocephaly, Odontogenic keratocysts of the jaw, Basal cell carcinoma, Ectopic posterior pituitary, Calcification of falx cerebri, Palmar pits, Cleft lip
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