Leistungsverzeichnis

panel : ID039.06
Ehlers-Danlos-Syndrom (EDS) : 21 Gene (83,076 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ADAMTS2 25410 AR EDS, Dermatosparaxis-Typ (EDSDERMS) SNV und CNV: Short Read NGS
AEBP1 618000 AR EDS, klassisch-ähnlicher Typ (EDSCLL2) SNV und CNV: Short Read NGS
B3GALT6 615349 AR EDS, spondylodysplastischer Typ (EDSSPD2) SNV und CNV: Short Read NGS
B4GALT7 130070 AR EDS, spondylodysplastischer Typ (EDSSPD1) SNV und CNV: Short Read NGS
C1R 130080 AD EDS, Parodontitis-Typ (EDSPD1) SNV und CNV: Short Read NGS
C1S 617174 AD EDS, Parodontitis-Typ (EDSPD2) SNV und CNV: Short Read NGS
CHST14 601776 AR EDS, muskulokontraktureller Typ (EDSMC1) SNV und CNV: Short Read NGS
COL1A1 130060 AD EDS, Arthrochalasie-Typ (EDSARTH1) SNV und CNV: Short Read NGS
COL1A2 617821 AD EDS, Arthrochalasie-Typ (EDSARTH2) SNV und CNV: Short Read NGS
COL1A2 225320 AR EDS, kardio-valvulärer Typ (EDSCV) SNV und CNV: Short Read NGS
COL3A1 130050 AD EDS, vaskulärer Typ (EDSVASC) SNV und CNV: Short Read NGS
COL5A1 130000 AD EDS, klassischer Typ (EDSCL1) SNV und CNV: Short Read NGS
COL5A2 130010 AD EDS, klassischer Typ (EDSCL2) SNV und CNV: Short Read NGS
COL12A1 616471 AD EDS, myopathischer Typ (EDSMYP) SNV und CNV: Short Read NGS
DSE 615539 AR EDS, muskulokontraktureller Typ (EDSMC2) SNV und CNV: Short Read NGS
FKBP14 614557 AR EDS, Kyphoskoliose-Typ (EDSKSCL2) SNV und CNV: Short Read NGS
PLOD1 225400 AR EDS, Kyphoskoliose-Typ (EDSKSCL1) SNV und CNV: Short Read NGS
PRDM5 614170 AR Brittle-Cornea-Syndrom (BCS2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC39A13 612350 AR EDS, spondylodysplastischer Typ (EDSSPD3) SNV und CNV: Short Read NGS
THBS2 620865 AD EDS, klassisch-ähnlicher Typ (EDSCLL3) SNV und CNV: Short Read NGS
TNXB 606408 AR EDS, klassisch-ähnlicher Typ (EDSCLL1) SNV und CNV: Short Read NGS
ZNF469 229200 AR Brittle-Cornea-Syndrom (BCS1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Ehlers-Danlos-Syndrom (EDS), autosomal-dominant
C1R, C1S, COL12A1, COL1A1, COL1A2, COL3A1, COL5A1, COL5A2, THBS2
Ehlers-Danlos-Syndrom (EDS), autosomal-rezessiv
ADAMTS2, AEBP1, B3GALT6, B4GALT7, CHST14, COL1A2, DSE, FKBP14, PLOD1, PRDM5, SLC39A13, TNXB, ZNF469
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ADAMTS2, AEBP1, B3GALT6, B4GALT7, C1R, C1S, CHST14, COL12A1, COL1A1, COL1A2, COL3A1, COL5A1, COL5A2, DSE, FKBP14, PLOD1, PRDM5, SLC39A13, THBS2, TNXB, ZNF469
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