Leistungsverzeichnis

panel : ID290.01
Nicht-syndromale Schwerhörigkeit, X-chromosomal (DFNX) : 8 Gene (17,097 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AIFM1 300614 XLR DFNX5 SNV und CNV: Short Read NGS
COL4A5 301050 XLD DFNX SNV und CNV: Short Read NGS
COL4A6 300914 XLR DFNX6 SNV und CNV: Short Read NGS
GPRASP2 301018 XLR DFNX7 SNV und CNV: Short Read NGS
POU3F4 304400 XLR DFNX2 SNV und CNV: Short Read NGS
PRPS1 304500 XL DFNX1 SNV und CNV: Short Read NGS
SMPX 300066 XLD DFNX4 SNV und CNV: Short Read NGS
TIMM8A 304700 XLR DFNX SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Nicht-syndromale Schwerhörigkeit, X-chromosomal (DFNX)
AIFM1, COL4A5, COL4A6, GPRASP2, POU3F4, PRPS1, SMPX, TIMM8A
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AIFM1, COL4A5, COL4A6, GPRASP2, POU3F4, PRPS1, SMPX, TIMM8A
HPO Terms
Hearing impairment, Sensorineural hearing impairment, Bilateral sensorineural hearing impairment, Congenital sensorineural hearing impairment, Progressive sensorineural hearing impairment, High-frequency hearing impairment, Abnormal cochlea morphology, Abnormal cochlear nerve hypoplasia, Tinnitus, Low-set ears, Abnormal middle ear reflexes, Conductive hearing impairment, Mixed hearing impairment, Stapes ankylosis, Stenosis of the external auditory canal, Atresia of the external auditory canal, X-linked inheritance, X-linked recessive inheritance, Congenital onset, Progressive
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