Leistungsverzeichnis

panel : ID379.00
Chronische Granulomatose (CGD) : 8 Gene (8,793 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 2 - 4 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
CYBA 233690 AR Chronische Granulomatose (CGD4) SNV und CNV: Short Read NGS
CYBB 306400 XLR Chronische Granulomatose (CGDX) SNV und CNV: Short Read NGS
CYBC1 618935 AR Chronische Granulomatose (CGD5) SNV und CNV: Short Read NGS
G6PD 300908 XL Glucose-6-Phophat-Dehydrogenase-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
NCF1 233700 AR Chronische Granulomatose (CGD1) SNV und CNV: Short Read NGS
NCF2 233710 AR Chronische Granulomatose (CGD2) SNV und CNV: Short Read NGS
NCF4 613960 AR Chronische Granulomatose (CGD3) SNV und CNV: Short Read NGS
RAC2 608203 AD Neutrophiles Immundefektsyndrom SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Chronische Granulomatose (CGD)
CYBA, CYBB, CYBC1, G6PD, NCF1, NCF2, NCF4, RAC2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CYBA, CYBB, CYBC1, G6PD, NCF1, NCF2, NCF4, RAC2
HPO Terms
Absence of bactericidal oxidative respiratory burst in phagocytes, Decreased activity of NADPH oxidase, Impaired oxidative burst, Recurrent infections, Recurrent bacterial infections, Recurrent abscess formation, Recurrent pneumonia, Recurrent sinusitis, Recurrent otitis media, Recurrent urinary tract infections, Granuloma, Fever, Splenomegaly, Hepatosplenomegaly, Abscess, Osteomyelitis, Recurrent bacterial skin infections, Recurrent mycobacterial infections, Elevated circulating C-reactive protein concentration, Recurrent respiratory infections
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