Leistungsverzeichnis

panel : ID341.01
Interstitielle Lungenerkrankung und Lungenfibrose : 40 Gene (80,862 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ABCA3 610921 AR Pulmonale Surfactant-Stoffwechsel-Dysfunktion (SMDP3) SNV und CNV: Short Read NGS
ACD 616553 AD, AR Dyskeratosis congenita (DKCA6, DKCB7) SNV und CNV: Short Read NGS
AP3B1 608233 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS2) SNV und CNV: Short Read NGS
AP3D1 617050 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS10) SNV und CNV: Short Read NGS
COPA 616414 AD Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (AILJK) SNV und CNV: Short Read NGS
CSF2RA 300770 XL Pulmonale Surfactant-Stoffwechsel-Dysfunktion (SMDP4) SNV und CNV: Short Read NGS
CSF2RB 614370 AR Pulmonale Surfactant-Stoffwechsel-Dysfunktion (SMDP5) SNV und CNV: Short Read NGS
DCLRE1B 620133 AR Dyskeratosis congenita (DKCB8) SNV und CNV: Short Read NGS
DKC1 305000 XLR Dyskeratosis congenita (DKCX) SNV und CNV: Short Read NGS
FAM111B 615704 AD Syndrom mit Lungenfibrose (POIKTMP) SNV und CNV: Short Read NGS
FARSA 619019 AR Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (RILDBC2) SNV und CNV: Short Read NGS
FARSB 613658 AR Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (RILDBC1) SNV und CNV: Short Read NGS
FLNA 300049 XLD Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (PVNH1) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXF1 265380 AD Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (ACDMPV) SNV und CNV: Short Read NGS
GBA1 230800 AR Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (GD1) SNV und CNV: Short Read NGS
HPS1 203300 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS1) SNV und CNV: Short Read NGS
HPS4 614073 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS4) SNV und CNV: Short Read NGS
ITGA3 614748 AR Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (JEB7) SNV und CNV: Short Read NGS
MARS1 615934 AR Syndrom mit pulmonaler Alveolarproteinose (ILLD) SNV und CNV: Short Read NGS
NAF1 617868 AD Telomer-assoziierte Lungenfibrose SNV und CNV: Short Read NGS
NHP2 613987 AR Dyskeratosis congenita (DKCB2) SNV und CNV: Short Read NGS
NKX2-1 610978 AD Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (CAHTP) SNV und CNV: Short Read NGS
NOP10 224230 AR Dyskeratosis congenita (DKCB1) SNV und CNV: Short Read NGS
OAS1 618042 AD Syndrom mit pulmonaler Alveolarproteinose (PAPHG) SNV und CNV: Short Read NGS
PARN 616371 AD Telomer-assoziierte Lungenfibrose (PFBMFT4) SNV und CNV: Short Read NGS
PARN 616353 AR Dyskeratosis congenita (DKCB6) SNV und CNV: Short Read NGS
RPA1 619767 AD Telomer-assoziierte Lungenfibrose (PFBMFT6) SNV und CNV: Short Read NGS
RTEL1 616373 AD Telomer-assoziierte Lungenfibrose (PFBMFT3) SNV und CNV: Short Read NGS
RTEL1 615190 AD, AR Dyskeratosis congenita (DKCA4, DKCB5) SNV und CNV: Short Read NGS
SFTPA1 619611 AD Interstitielle Lungenerkrankung (ILD1) SNV und CNV: Short Read NGS
SFTPA2 178500 AD Interstitielle Lungenerkrankung (ILD2) SNV und CNV: Short Read NGS
SFTPB 265120 AR Pulmonale Surfactant-Stoffwechsel-Dysfunktion (SMDP1) SNV und CNV: Short Read NGS
SFTPC 610913 AD Pulmonale Surfactant-Stoffwechsel-Dysfunktion (SMDP2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC7A7 222700 AR Syndrom mit pulmonaler Alveolarproteinose (LPI) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC34A2 265100 AR Syndrom mit Lungenfibrose (PULAM) SNV und CNV: Short Read NGS
SMPD1 607616 AR Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (ASMD) SNV und CNV: Short Read NGS
STING1 615934 AD Syndrom mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung (SAVI) SNV und CNV: Short Read NGS
TERC 614743 AD Telomer-assoziierte Lungenfibrose (PFBMFT2) SNV und CNV: Short Read NGS
TERC 127550 AD Dyskeratosis congenita (DKCA1) SNV und CNV: Short Read NGS
TERT 614742 AD Telomer-assoziierte Lungenfibrose (PFBMFT1) SNV und CNV: Short Read NGS
TERT 613989 AD, AR Dyskeratosis congenita (DKCA2, DKCB4) SNV und CNV: Short Read NGS
TINF2 613990 AD Dyskeratosis congenita (DKCA3, DKCA5) SNV und CNV: Short Read NGS
WRAP53 613988 AR Dyskeratosis congenita (DKCB3) SNV und CNV: Short Read NGS
ZCCHC8 618674 AD Telomer-assoziierte Lungenfibrose (PFBMFT5) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Pulmonale Alveolarproteinose (SMDP, ILD)
ABCA3, CSF2RA, CSF2RB, MARS1, OAS1, SFTPA1, SFTPA2, SFTPB, SFTPC, SLC7A7
Telomer-assoziierte Lungenfibrose (PFBMFT, DKC)
ACD, DCLRE1B, DKC1, NAF1, NHP2, NOP10, PARN, RPA1, RTEL1, TERC, TERT, TINF2, WRAP53, ZCCHC8
Syndrome mit Lungenfibrose
ACD, AP3B1, AP3D1, DKC1, FAM111B, HPS1, HPS4, NAF1, NHP2, NOP10, PARN, RTEL1, SLC34A2, TERT, TINF2, WRAP53
Syndrome mit diffuser parenchymaler Lungenerkrankung
COPA, FARSA, FARSB, FLNA, FOXF1, GBA1, ITGA3, NKX2-1, SMPD1, STING1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCA3, ACD, AP3B1, AP3D1, COPA, CSF2RA, CSF2RB, DCLRE1B, DKC1, FAM111B, FARSA, FARSB, FLNA, FOXF1, GBA1, HPS1, HPS4, ITGA3, MARS1, NAF1, NHP2, NKX2-1, NOP10, OAS1, PARN, RPA1, RTEL1, SFTPA1, SFTPA2, SFTPB, SFTPC, SLC34A2, SLC7A7, SMPD1, STING1, TERC, TERT, TINF2, WRAP53, ZCCHC8
HPO Terms
Honeycomb lung, Ground-glass opacification, Subpleural honeycombing, Reticular pattern on pulmonary HRCT, Crazy paving pattern, Nodular pattern on pulmonary HRCT, Bronchial wall thickening, Pulmonary fibrosis, Interstitial pneumonitis, Nonspecific interstitial pneumonia, Usual interstitial pneumonia, Pulmonary arterial hypertension, Pulmonary edema, Pulmonary infiltrates, Pulmonary opacity, Reduced forced vital capacity, Reduced DLCO, Dyspnea, Crackles, Clubbing
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