Leistungsverzeichnis

panel : ID221.04
Hydrozephalie : 20 Gene (57,921 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AKT3 615937 AD MPPH-Syndrom (MPPH2) SNV und CNV: Short Read NGS
CCDC88C 236600 AR Kongenitaler Hydrozephalus (HYC1) SNV und CNV: Short Read NGS
CCND2 615938 AD MPPH-Syndrom (MPPH3) SNV und CNV: Short Read NGS
CFAP43 236690 AD Normaldruck-Hydrozephalus (HYDNP1) SNV und CNV: Short Read NGS
FANCB 300514 XLR VACTERL-Assoziation mit Hydrozephalus (VACTERL-H) SNV und CNV: Short Read NGS
FLVCR2 225790 AR Fowler-Syndrom (PVHH) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXJ1 618699 AD Ziliopathie mit Hydrozephalus (CILD43) SNV und CNV: Short Read NGS
GPSM2 604213 AR Chudley-McCullough-Syndrom (CMCS) SNV und CNV: Short Read NGS
HYLS1 236680 AR Hydroletalus-Syndrom (HLS1) SNV und CNV: Short Read NGS
KIF7 614120 AR Hydroletalus-Syndrom (HLS2) SNV und CNV: Short Read NGS
L1CAM 307000 XLR Kongenitaler Hydrozephalus (HYCX, HSAS) SNV und CNV: Short Read NGS
L1CAM 303350 XLR MASA-Syndrom (SPG1) SNV und CNV: Short Read NGS
MPDZ 615219 AR Kongenitaler Hydrozephalus (HYC2) SNV und CNV: Short Read NGS
P4HB 112240 AD Cole-Carpenter-Syndrom (CLCRP1) SNV und CNV: Short Read NGS
PIK3R2 603387 AD MPPH-Syndrom (MPPH1) SNV und CNV: Short Read NGS
POMT1 236670 AR HARD-Syndrom (MDDGA1) SNV und CNV: Short Read NGS
SEC24D 607186 AR Cole-Carpenter-Syndrom (CLCRP2) SNV und CNV: Short Read NGS
SMARCC1 620241 AD Kongenitaler Hydrozephalus (HYC5) SNV und CNV: Short Read NGS
TRIM71 618667 AD Kongenitaler Hydrozephalus (HYC4) SNV und CNV: Short Read NGS
WDR81 617967 AR Kongenitaler Hydrozephalus (HYC3) SNV und CNV: Short Read NGS
ZIC3 314390 XLR VACTERL-Assoziation mit Hydrozephalus (VACTERL-H) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kongenitaler Hydrozephalus (HYC)
CCDC88C, L1CAM, MPDZ, SMARCC1, TRIM71, WDR81
Syndrome mit Hydrozephalus
AKT3, CCND2, FANCB, FLVCR2, FOXJ1, GPSM2, HYLS1, KIF7, P4HB, PIK3R2, POMT1, SEC24D, ZIC3
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AKT3, CCDC88C, CCND2, CFAP43, FANCB, FLVCR2, FOXJ1, GPSM2, HYLS1, KIF7, L1CAM, MPDZ, P4HB, PIK3R2, POMT1, SEC24D, SMARCC1, TRIM71, WDR81, ZIC3
HPO Terms
Hydrocephalus, Ventriculomegaly, Noncommunicating hydrocephalus, Communicating hydrocephalus, Normal pressure hydrocephalus, Enlarged cisterna magna, Increased intracranial pressure, Macrocephaly, Seizure, Epileptic spasm, Status epilepticus, EEG abnormality, Developmental delay, Intellectual disability, Cognitive impairment, Global developmental delay, Abnormal brain morphology, Abnormal cerebral white matter morphology, Abnormal cortical gyration, Abnormal cerebellar vermis morphology
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