Leistungsverzeichnis - Primäre Mikrozephalie, autosomal-rezessiv (MCPH) : 28 Gene (111,627 kb)

Material	Dauer	Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut	4 - 6 Wochen	ja

Untersuchte Bereiche / Gene

Genotyp	OMIM-P	Erbgang	Phänotyp	Methodik
ANKLE2	616681	AR	MCPH16	SNV und CNV: Short Read NGS
ASPM	608716	AR	MCPH5	SNV und CNV: Short Read NGS
CDK5RAP2	604804	AR	MCPH3	SNV und CNV: Short Read NGS
CDK6	616090	AR	MCPH12	SNV und CNV: Short Read NGS
CENPE	616051	AR	MCPH13	SNV und CNV: Short Read NGS
CEP135	614673	AR	MCPH8	SNV und CNV: Short Read NGS
CEP152	614852	AR	MCPH9	SNV und CNV: Short Read NGS
CIT	618179	AR	MCPH17	SNV und CNV: Short Read NGS
COPB2	617800	AR	MCPH19	SNV und CNV: Short Read NGS
CPAP	608393	AR	MCPH6	SNV und CNV: Short Read NGS
KIF14	617914	AR	MCPH20	SNV und CNV: Short Read NGS
KNL1	604321	AR	MCPH4	SNV und CNV: Short Read NGS
LMNB1	619179	AD	MCPH26	SNV und CNV: Short Read NGS
LMNB2	619180	AD	MCPH27	SNV und CNV: Short Read NGS
MCPH1	251200	AR	MCPH1	SNV und CNV: Short Read NGS
MFSD2A	616486	AR	MCPH15	SNV und CNV: Short Read NGS
NCAPD2	617983	AR	MCPH21	SNV und CNV: Short Read NGS
NCAPD3	617984	AR	MCPH22	SNV und CNV: Short Read NGS
NCAPH	617985	AR	MCPH23	SNV und CNV: Short Read NGS
NUP37	618179	AR	MCPH24	SNV und CNV: Short Read NGS
PHC1	615414	AR	MCPH11	SNV und CNV: Short Read NGS
RRP7A	619453	AR	MCPH28	SNV und CNV: Short Read NGS
SASS6	616402	AR	MCPH14	SNV und CNV: Short Read NGS
STIL	612703	AR	MCPH7	SNV und CNV: Short Read NGS
TRAPPC14	618351	AR	MCPH25	SNV und CNV: Short Read NGS
WDFY3	617520	AR	MCPH18	SNV und CNV: Short Read NGS
WDR62	604317	AR	MCPH2	SNV und CNV: Short Read NGS
ZNF335	615095	AR	MCPH10	SNV und CNV: Short Read NGS

Methodik

ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.

Primäre Mikrozephalie, autosomal-rezessiv (MCPH)

ANKLE2, ASPM, CDK5RAP2, CDK6, CENPE, CEP135, CEP152, CIT, COPB2, CPAP, KIF14, KNL1, LMNB1, LMNB2, MCPH1, MFSD2A, NCAPD2, NCAPD3, NCAPH, NUP37, PHC1, RRP7A, SASS6, STIL, TRAPPC14, WDFY3, WDR62, ZNF335

Kosten

Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.

Gesamte Genliste

ANKLE2, ASPM, CDK5RAP2, CDK6, CENPE, CEP135, CEP152, CIT, COPB2, CPAP, KIF14, KNL1, LMNB1, LMNB2, MCPH1, MFSD2A, NCAPD2, NCAPD3, NCAPH, NUP37, PHC1, RRP7A, SASS6, STIL, TRAPPC14, WDFY3, WDR62, ZNF335

HPO Terms

Primary microcephaly, Microcephaly, Intellectual disability, severe, Intellectual disability, moderate, Intellectual disability, mild, Global developmental delay, Seizure, Status epilepticus, Febrile seizure, Tonic seizure, Lissencephaly, Pachygyria, Polymicrogyria, Abnormal cortical gyration, Thin corpus callosum, Corpus callosum atrophy, Cerebellar hypoplasia, Ventriculomegaly, Hydrocephalus, Spasticity