Leistungsverzeichnis

panel : ID264.00
Neurodegeneration mit Eisenablagerung im Gehirn (NBIA) : 11 Gene (20,001 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ATP13A2 606693 AR NBIA (KRS) SNV und CNV: Short Read NGS
C19orf12 614298 AD, AR NBIA4 SNV und CNV: Short Read NGS
COASY 615643 AR NBIA6 SNV und CNV: Short Read NGS
CP 604290 AR NBIA SNV und CNV: Short Read NGS
CRAT 617917 AR NBIA8 SNV und CNV: Short Read NGS
FA2H 612319 AR NBIA (FAHN) SNV und CNV: Short Read NGS
FTL 606159 AD NBIA3 SNV und CNV: Short Read NGS
PANK2 234200 AR NBIA1 SNV und CNV: Short Read NGS
PLA2G6 256600 AR NBIA2A SNV und CNV: Short Read NGS
PLA2G6 610217 AR NBIA2B SNV und CNV: Short Read NGS
REPS1 617916 AR NBIA7 SNV und CNV: Short Read NGS
WDR45 300894 XLD NBIA5 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Neurodegeneration mit Eisenablagerung im Gehirn (NBIA)
ATP13A2, C19orf12, COASY, CP, CRAT, FA2H, FTL, PANK2, PLA2G6, PLA2G6, REPS1, WDR45
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ATP13A2, C19orf12, COASY, CP, CRAT, FA2H, FTL, PANK2, PLA2G6, REPS1, WDR45
HPO Terms
Dystonia, Parkinsonism, Iron accumulation in brain, Optic atrophy, Spasticity, Gait disturbance, Ataxia, Tremor, Cognitive decline, Visual impairment, Hypertonia, Dysarthria, Dysphagia, Seizure, Progressive spastic paraparesis, Memory impairment, Axial hypotonia, Neurodegeneration, Retinal degeneration
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