Leistungsverzeichnis

panel : ID152.03
Spinale Muskelatrophie (SMA) : 41 Gene (91,728 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AR 313200 XLR Spinobulbäre Muskelatrophie (SMAX1) SNV und CNV: Short Read NGS
ASAH1 159950 AR Spinale Muskelatrophie mit Myoklonusepilepsie (SMAPME) SNV und CNV: Short Read NGS
ASCC1 616867 AR Spinale Muskelatrophie mit Knochenfrakturen (SMABF2) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP7A 300489 XLR Distale motorische Neuronopathie (SMAX3, HMNX, DSMAX) SNV und CNV: Short Read NGS
BAG3 621094 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND15) SNV und CNV: Short Read NGS
BICD2 615290 AD Proximale spinale Muskelatrophie (SMALED2A) SNV und CNV: Short Read NGS
BICD2 618291 AD Proximale spinale Muskelatrophie (SMALED2B) SNV und CNV: Short Read NGS
BSCL2 619112 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND13) SNV und CNV: Short Read NGS
CHCHD10 615048 AD Spinale Muskelatrophie, Jokela-Typ (SMAJ) SNV und CNV: Short Read NGS
COQ7 620402 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR9) SNV und CNV: Short Read NGS
DCTN1 607641 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND14) SNV und CNV: Short Read NGS
DNAJB2 614881 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR5, DSMA5) SNV und CNV: Short Read NGS
DYNC1H1 158600 AD Proximale spinale Muskelatrophie (SMALED1) SNV und CNV: Short Read NGS
EMILIN1 620080 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND10) SNV und CNV: Short Read NGS
EXOSC3 614678 AR Pontozerebelläre Hypoplasie mit spinaler Muskelatrophie (PCH1B) SNV und CNV: Short Read NGS
EXOSC8 616081 AR Pontozerebelläre Hypoplasie mit spinaler Muskelatrophie (PCH1C) SNV und CNV: Short Read NGS
EXOSC9 6018065 AR Pontozerebelläre Hypoplasie mit spinaler Muskelatrophie (PCH1D) SNV und CNV: Short Read NGS
FBXO38 615575 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND6) SNV und CNV: Short Read NGS
GARS1 600287 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND5) SNV und CNV: Short Read NGS
GARS1 619042 AD Spinale Muskelatrophie, James-Typ (SMAJI) SNV und CNV: Short Read NGS
HSPB1 608634 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND3) SNV und CNV: Short Read NGS
HSPB3 613376 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND4) SNV und CNV: Short Read NGS
HSPB8 158590 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND2) SNV und CNV: Short Read NGS
IGHMBP2 604320 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR1, DSMA1) SNV und CNV: Short Read NGS
PLEKHG5 611067 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR4; DSMA4) SNV und CNV: Short Read NGS
REEP1 620011 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR6, DSMA6) SNV und CNV: Short Read NGS
REEP1 614751 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND12) SNV und CNV: Short Read NGS
RTN2 620854 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR11) SNV und CNV: Short Read NGS
SETX 602433 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND) SNV und CNV: Short Read NGS
SIGMAR1 605726 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR2, DSMA2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC5A7 158580 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND7) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC25A46 619303 AR Pontozerebelläre Hypoplasie mit spinaler Muskelatrophie (PCH1E) SNV und CNV: Short Read NGS
SMN1 253300 AR Akute infantile spinale Muskelatrophie (SMA1) SNV und CNV: Short Read NGS
SMN1 253550 AR Intermediäre spinale Muskelatrophie (SMA2) SNV und CNV: Short Read NGS
SMN1 253400 AR Juvenile spinale Muskelatrophie (SMA3) SNV und CNV: Short Read NGS
SMN1 271150 AR Adulte spinale Muskelatrophie (SMA4) SNV und CNV: Short Read NGS
SMN2 253400 AR Spinale Muskelatrophie, Modifier (SMA) SNV und CNV: Short Read NGS
SORD 618912 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR8) SNV und CNV: Short Read NGS
SPTAN1 620528 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND11) SNV und CNV: Short Read NGS
SYT2 616040 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND) SNV und CNV: Short Read NGS
TRIP4 616866 AR Spinale Muskelatrophie mit Knochenfrakturen (SMABF1) SNV und CNV: Short Read NGS
TRPV4 600175 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND8) SNV und CNV: Short Read NGS
TRPV4 181405 AD Skapuloperoneale spinale Muskelatrophie (SPSMA) SNV und CNV: Short Read NGS
UBA1 301830 XLR Spinale Muskelatrophie (SMAX2) SNV und CNV: Short Read NGS
VAPB 605704 AD Spinale Muskelatrophie, Finkel-Typ (SMAFK) SNV und CNV: Short Read NGS
VRK1 620542 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR10) SNV und CNV: Short Read NGS
VRK1 607596 AR Pontozerebelläre Hypoplasie mit spinaler Muskelatrophie (PCH1A) SNV und CNV: Short Read NGS
VWA1 619216 AR Distale motorische Neuronopathie (HMNR7) SNV und CNV: Short Read NGS
WARS1 617721 AD Distale motorische Neuronopathie (HMND9) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Proximale spinale Muskelatrophie (SMA)
AR, ASAH1, ASCC1, BICD2, CHCHD10, DYNC1H1, GARS1, SMN1, SMN2, TRIP4, TRPV4, UBA1, VAPB
Distale spinale Muskelatrophie (DSMA, HMN)
ATP7A, BAG3, BSCL2, COQ7, DCTN1, DNAJB2, EMILIN1, FBXO38, GARS1, HSPB1, HSPB3, HSPB8, IGHMBP2, PLEKHG5, REEP1, RTN2, SETX, SIGMAR1, SLC5A7, SORD, SPTAN1, SYT2, TRPV4, VRK1, VWA1, WARS1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AR, ASAH1, ASCC1, ATP7A, BAG3, BICD2, BSCL2, CHCHD10, COQ7, DCTN1, DNAJB2, DYNC1H1, EMILIN1, EXOSC3, EXOSC8, EXOSC9, FBXO38, GARS1, HSPB1, HSPB3, HSPB8, IGHMBP2, PLEKHG5, REEP1, RTN2, SETX, SIGMAR1, SLC25A46, SLC5A7, SMN1, SMN2, SORD, SPTAN1, SYT2, TRIP4, TRPV4, UBA1, VAPB, VRK1, VWA1, WARS1
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