Leistungsverzeichnis

panel : ID156.01
Bartter-Syndrom (BARTS) : 8 Gene (17,718 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
BSND 602522 AR BARTS4A SNV und CNV: Short Read NGS
CASR 601198 AD Hypokalzämie mit BARTS (HYPOC1) SNV und CNV: Short Read NGS
CLCNKA 613090 DR BARTS4B SNV und CNV: Short Read NGS
CLCNKB 607364 AR BARTS3 SNV und CNV: Short Read NGS
CLCNKB 613090 DR BARTS4B SNV und CNV: Short Read NGS
KCNJ1 241200 AR BARTS2 SNV und CNV: Short Read NGS
MAGED2 300971 XLR BARTS5 SNV und CNV: Short Read NGS
SLC12A1 601678 AR BARTS1 SNV und CNV: Short Read NGS
SLC12A3 263800 AR Gitelman-Syndrom (GTLMNS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Bartter-Syndrom (BARTS)
BSND, CASR, CLCNKA, CLCNKB, CLCNKB, KCNJ1, MAGED2, SLC12A1, SLC12A3
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
BSND, CASR, CLCNKA, CLCNKB, KCNJ1, MAGED2, SLC12A1, SLC12A3
HPO Terms
Renal salt wasting, Hypokalemic hypochloremic metabolic alkalosis, Polyuria, Polydipsia, Nephrocalcinosis, Hypercalciuria, Hypomagnesemia, Renal insufficiency, Chronic kidney disease, Renal potassium wasting, Hypokalemia, Increased circulating renin concentration, Increased circulating aldosterone concentration, Hypocalciuria, Congenital onset, Neonatal onset, Failure to thrive, Growth retardation, Hypernatriuria, Hypochloremia
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