Leistungsverzeichnis

panel : ID320.01
Renale Amyloidose : 9 Gene (13,164 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
APOA1 620657 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD3) SNV und CNV: Short Read NGS
B2M 620659 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD6) SNV und CNV: Short Read NGS
FGA 105200 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD2) SNV und CNV: Short Read NGS
GSN 105120 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD4) SNV und CNV: Short Read NGS
LYZ 620658 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD5) SNV und CNV: Short Read NGS
MEFV 249100 AD Familiäres Mittelmeerfieber (FMF) SNV und CNV: Short Read NGS
NLRP3 191900 AD Muckle-Wells-Syndrom (MWS) SNV und CNV: Short Read NGS
TNFRSF1A 142680 AD Familiäres periodisches Fieber (FPF) SNV und CNV: Short Read NGS
TTR 105210 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD)
APOA1, B2M, FGA, GSN, LYZ, TTR
Periodische Fiebersyndrome mit Amyloidose
MEFV, NLRP3, TNFRSF1A
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
APOA1, B2M, FGA, GSN, LYZ, MEFV, NLRP3, TNFRSF1A, TTR
HPO Terms
Renal amyloidosis, Renal glomerular amyloid deposition, Nephrotic syndrome, Proteinuria, Hematuria, Chronic kidney disease, Stage 5 chronic kidney disease, Renal insufficiency, Hypoalbuminemia, Hypoproteinemia, Nephropathy, Glomerulonephritis, Amyloidosis, Generalized amyloid deposition, Abnormal renal physiology, Glomerulopathy, Nephrocalcinosis, Urolithiasis, Abnormal circulating amyloid A concentration, Proteinuria
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