Leistungsverzeichnis

panel : ID259.00
Adams-Oliver-Syndrom (AOS) : 6 Gene (23,292 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ARHGAP31 615297 AR AOS1 SNV und CNV: Short Read NGS
DLL4 616589 AD AOS6 SNV und CNV: Short Read NGS
DOCK6 614219 AR AOS2 SNV und CNV: Short Read NGS
EOGT 615297 AR AOS4 SNV und CNV: Short Read NGS
NOTCH1 616028 AD AOS5 SNV und CNV: Short Read NGS
RBPJ 614814 AD AOS3 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Adams-Oliver-Syndrom (AOS)
ARHGAP31, DLL4, DOCK6, EOGT, NOTCH1, RBPJ
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ARHGAP31, DLL4, DOCK6, EOGT, NOTCH1, RBPJ
HPO Terms
Aplasia cutis congenita, Transverse limb defect, Oligodactyly, Syndactyly, Brachydactyly, Absent distal phalanges, Ventricular septal defect, Patent ductus arteriosus, Bicuspid aortic valve, Coarctation of aorta, Pulmonary artery stenosis, Developmental delay, Intellectual disability, Seizure, Hypotonia, Aplasia cutis congenita of scalp, Abnormal metacarpal morphology, Short palm, Cutis marmorata telangiectatica congenita, Aortic valve stenosis
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