Leistungsverzeichnis

panel : ID265.01
Orofaziodigitales Syndrom (OFD) : 14 Gene (40,230 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
C2CD3 615948 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD14) SNV und CNV: Short Read NGS
CPLANE1 277170 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD6) SNV und CNV: Short Read NGS
DDX59 174300 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD5) SNV und CNV: Short Read NGS
IFT57 617927 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD18) SNV und CNV: Short Read NGS
INTU 617926 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD17) SNV und CNV: Short Read NGS
KIAA0753 617127 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD15) SNV und CNV: Short Read NGS
NEK1 252100 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD2) SNV und CNV: Short Read NGS
OFD1 311200 XLD Orofaziodigitales Syndrom (OFD1) SNV und CNV: Short Read NGS
RAB34 620718 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD20) SNV und CNV: Short Read NGS
SCNM1 620107 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD19) SNV und CNV: Short Read NGS
TBC1D32 258865 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD9) SNV und CNV: Short Read NGS
TCTN3 258860 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD4) SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM107 617563 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD16) SNV und CNV: Short Read NGS
ZRSR2 301132 XLR Orofaziodigitales Syndrom (OFD21) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Orofaziodigitales Syndrom (OFD)
C2CD3, CPLANE1, DDX59, IFT57, INTU, KIAA0753, NEK1, OFD1, RAB34, SCNM1, TBC1D32, TCTN3, TMEM107, ZRSR2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
C2CD3, CPLANE1, DDX59, IFT57, INTU, KIAA0753, NEK1, OFD1, RAB34, SCNM1, TBC1D32, TCTN3, TMEM107, ZRSR2
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