Leistungsverzeichnis

panel : ID334.00
Folatstoffwechselstörung : 10 Gene (18,654 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
CBS 236200 AR Homocystinurie durch CBS-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
FOLR1 613068 AR Zerebrale Folattransportdefizienz (NCFTD) SNV und CNV: Short Read NGS
FOLR2 136425 AR Zerebrale Folattransportdefizienz (NCFTD) SNV und CNV: Short Read NGS
FTCD 229100 AR Formiminoglutaminsäure-Krankheit SNV und CNV: Short Read NGS
MTHFD1 601634 AR Neuralrohrdefekte, Folat-sensitiv (NTDFS) SNV und CNV: Short Read NGS
MTHFD1 617780 AR Immunschwäche und Megablastäre Anämie (CIMAH) SNV und CNV: Short Read NGS
MTHFR 601634 AR Neuralrohrdefekte, Folat-sensitiv (NTDFS) SNV und CNV: Short Read NGS
MTHFR 236250 AR Homocystinurie durch MTHFR-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
MTR 601634 AR Neuralrohrdefekte, Folat-sensitiv (NTDFS) SNV und CNV: Short Read NGS
MTR 250940 AR Homocystinurie – Megaloblastäre Anämie (HMAG) SNV und CNV: Short Read NGS
MTRR 601634 AR Neuralrohrdefekte, Folat-sensitiv (NTDFS) SNV und CNV: Short Read NGS
MTRR 236270 AR Homocystinurie – Megaloblastäre Anämie (HMAE) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC19A1 601775 AR Megablastäre Anämie, Folat-responsiv SNV und CNV: Short Read NGS
SLC46A1 229050 AR Hereditäre Folat-Malabsorption SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Folatstoffwechselstörung
CBS, FOLR1, FOLR2, FTCD, MTHFD1, MTHFD1, MTHFR, MTHFR, MTR, MTR, MTRR, MTRR, SLC19A1, SLC46A1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CBS, FOLR1, FOLR2, FTCD, MTHFD1, MTHFR, MTR, MTRR, SLC19A1, SLC46A1
HPO Terms
Megaloblastic anemia, Macrocytic anemia, Anemia of inadequate production, Hypersegmentation of neutrophil nuclei, Neutropenia, Thrombocytopenia, Anemia, Global developmental delay, Intellectual disability, Seizure, Ataxia, Spasticity, Hypertonia, Hypopigmentation of the skin, Sparse scalp hair, Brittle hair, Abnormality of folate metabolism, Increased blood folate concentration, Decreased circulating vitamin B12 concentration, Abnormal circulating enzyme concentration or activity
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