Leistungsverzeichnis

panel : ID291.00
Glykosylphosphatidylinositol-Biosynthesedefekt (GPIBD) : 22 Gene (33,258 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
GPAA1 617810 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD15) SNV und CNV: Short Read NGS
PGAP1 615802 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD9) SNV und CNV: Short Read NGS
PGAP2 614207 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD8, HPMRS3) SNV und CNV: Short Read NGS
PGAP3 615716 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD10, HPMRS4) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGA 300868 XLR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD4, MCAHS2) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGB 618580 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD20) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGC 617816 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD16) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGG 616917 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD13) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGH 618010 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD17) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGK 618879 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD22) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGL 280000 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD5) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGM 610293 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD1) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGN 614080 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD3, MCAHS1) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGO 614749 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD6, HPMRS2) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGP 617599 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD14) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGQ 618548 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD19, MCAHS4) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGS 618143 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD18) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGT 615398 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD7, MCAHS3) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGU 618590 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD21) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGV 239300 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD2, HPMRS1) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGW 616025 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD11, HPMRS5) SNV und CNV: Short Read NGS
PIGY 616809 AR GPI-Biosynthesedefekt (GPIBD12, HPMRS6) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Multiple kongenitale Anomalien-Hypotonie-Krampfanfälle-Syndrom (MCAHS)
PIGA, PIGN, PIGQ, PIGT
Hyperphosphatasie-Intelligenzminderung-Syndrom (HPMRS)
PGAP2, PGAP3, PIGO, PIGV, PIGW, PIGY
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
GPAA1, PGAP1, PGAP2, PGAP3, PIGA, PIGB, PIGC, PIGG, PIGH, PIGK, PIGL, PIGM, PIGN, PIGO, PIGP, PIGQ, PIGS, PIGT, PIGU, PIGV, PIGW, PIGY
HPO Terms
Intellectual disability, Developmental delay, Seizure, Hypotonia, Spasticity, Ataxia, Dysarthria, Dysphagia, Feeding difficulties, Nystagmus, Visual impairment, Hearing impairment, Short stature, Microcephaly, Hypertelorism, Prominent forehead, Broad nasal tip, Abnormal facial shape, Bilateral ptosis, Dysmorphic facial features
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