Leistungsverzeichnis

panel : ID313.00
Glioblastom (GLM) : 16 Gene (61,008 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
APC 175100 AD Hirntumor-Polyposis-Syndrom (BTPS2) SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA1 137800 AR, AD Gliom-Prädisposition (GLM) SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA2 613029 AR, AD Gliom-Prädisposition (GLM3) SNV und CNV: Short Read NGS
CDKN2A 155755 AD Melanom-Astrozytom-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
EPCAM 619096 AR Hirntumor-Polyposis-Syndrom (BTPS1, MMRCS) SNV und CNV: Short Read NGS
MLH1 276300 AR Hirntumor-Polyposis-Syndrom (BTPS1, MMRCS1) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH2 619096 AR Hirntumor-Polyposis-Syndrom (BTPS1, MMRCS2) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH6 619097 AR Hirntumor-Polyposis-Syndrom (BTPS1, MMRCS3) SNV und CNV: Short Read NGS
NF1 162200 AD Neurofibromatose (NF1) SNV und CNV: Short Read NGS
NF2 101000 AD Neurofibromatose (NF2) SNV und CNV: Short Read NGS
PMS2 600300 AR Hirntumor-Polyposis-Syndrom (BTPS1, MMRCS4) SNV und CNV: Short Read NGS
POT1 616568 AD Gliom-Prädisposition (GLM9) SNV und CNV: Short Read NGS
PTEN 613028 AD Gliom-Prädisposition (GLM2) SNV und CNV: Short Read NGS
TP53 137800 AD Gliom-Prädisposition (GLM1) SNV und CNV: Short Read NGS
TP53 151623 AD Li-Fraumeni-Syndrom (LSF1) SNV und CNV: Short Read NGS
TSC1 191100 AD Tuberöse Sklerose (TSC1) SNV und CNV: Short Read NGS
TSC2 613254 AD Tuberöse Sklerose (TSC1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Glioblastom (GLM)
APC, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, NF1, NF2, PMS2, POT1, PTEN, TP53, TP53, TSC1, TSC2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
APC, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, NF1, NF2, PMS2, POT1, PTEN, TP53, TSC1, TSC2
HPO Terms
Increased intracranial pressure, Headache, Vomiting, Seizure, Focal-onset seizure, Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset, Hemiplegia/hemiparesis, Gait disturbance, Spastic gait, Ataxia, Cranial nerve paralysis, Papilledema, Visual impairment, Visual field defect, Visual acuity no light perception, Brain neoplasm, Neoplasm of central nervous system, Hydrocephalus, Cognitive impairment, Personality changes
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