Leistungsverzeichnis

panel : ID003.05
Mamma- und Ovarialkarzinom (HBOC) : 20 Gene (63,408 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ATM 208900 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (AT) SNV und CNV: Short Read NGS
BARD1 114480 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA1 604370 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (BROVCA1) SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA2 612555 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (BROVCA2) SNV und CNV: Short Read NGS
BRIP1 114480 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
CDH1 137215 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (DBLBC) SNV und CNV: Short Read NGS
CHEK2 609265 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (TPDS4) SNV und CNV: Short Read NGS
EPCAM 613244 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (LYNCH8) SNV und CNV: Short Read NGS
MLH1 609310 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (LYNCH2) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH2 120435 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (LYNCH1) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH6 614350 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (LYNCH5) SNV und CNV: Short Read NGS
NTHL1 616415 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (FAP3) SNV und CNV: Short Read NGS
PALB2 620442 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (BROVCA5) SNV und CNV: Short Read NGS
PMS2 614337 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (LYNCH4) SNV und CNV: Short Read NGS
PTEN 158350 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (CWS1) SNV und CNV: Short Read NGS
RAD51C 613399 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (BROVCA3) SNV und CNV: Short Read NGS
RAD51D 614291 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (BROVCA4) SNV und CNV: Short Read NGS
SMARCA4 613325 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (RTPS2) SNV und CNV: Short Read NGS
STK11 175200 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (PJS) SNV und CNV: Short Read NGS
TP53 151623 AD Prädisposition für Brust- und Eierstockkrebs (LSF1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Mamma- und Ovarialkarzinom (HBOC)
ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, NTHL1, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, SMARCA4, STK11, TP53
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, NTHL1, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, SMARCA4, STK11, TP53
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