Leistungsverzeichnis

panel : ID223.02
Sarkom der Weichteile und des Skelettsystems : 55 Gene (155,130 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 4 - 6 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
APC
ATM
ATR
ATRX
BLM
BRCA2
BUB1B
CDKN1C
CDKN2A
CEP57
CHEK2
DICER1
DKC1
EPCAM
ERCC2
EXT1
EXT2
FAH
FANCC
FH
HRAS
KIT
MEN1
MLH1
MRE11
MSH2
MSH6
MTAP
NBN
NF1
PALB2
PDGFRA
PMS2
POT1
PRKAR1A
PTCH1
PTEN
RB1
RECQL4
RPS19
SDHA
SDHB
SDHC
SDHD
SMARCA4
SMARCB1
SQSTM1
SUFU
TBXT
TNFRSF11A
TP53
VHL
WAS
WRN
ZNF687
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
APC, ATM, ATR, ATRX, BLM, BRCA2, BUB1B, CDKN1C, CDKN2A, CEP57, CHEK2, DICER1, DKC1, EPCAM, ERCC2, EXT1, EXT2, FAH, FANCC, FH, HRAS, KIT, MEN1, MLH1, MRE11, MSH2, MSH6, MTAP, NBN, NF1, PALB2, PDGFRA, PMS2, POT1, PRKAR1A, PTCH1, PTEN, RB1, RECQL4, RPS19, SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, SMARCA4, SMARCB1, SQSTM1, SUFU, TBXT, TNFRSF11A, TP53, VHL, WAS, WRN, ZNF687
HPO Terms
Soft tissue mass, Soft tissue swelling, Bone metastasis, Bone pain, Bone tenderness, Bone fracture, Bone lesion, Bone swelling, Bone infiltration, Bone marrow infiltration, Bone hypertrophy, Bone lysis, Bone mass, Metastasis, Tumor, Cyst, Pain, Tenderness, Mass, Swelling
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